- Дао Чонг Тхи (Вьетнам)
Кандидатская: "Минимальные потоки и поверхности в римановых многообразиях" (1977 год). - Дао Чонг Тхи (Вьетнам)
Докторская: "Мультиварифолды и проблема минимизации функционалов типа многомерного объема" (1980 год) - Трофимов Валерий Владимирович
Кандидатская: "Полная интегрируемость уравнений Эйлера на борелевских лодалгебрах простых алгебр Ли" (1980 год) - Беляев Александр Владимирович
Кандидатская: "О движении n-мерного твердого тела в поле с линейным потенциалом" (1984 год) - Ле Нгок Тьеуен (Вьетнам)
Кандидатская: "Полные иниволютивные наборы полиномиальных функций на конечномерных алгебрах Ли" (1985 год) - Плужников Андрей Иванович
Кандидатская: "Гармонические отображения римановых многообразий" (1985 год) - Ле Хонг Ван (Вьетнам)
Кандидатская: "Абсолютно минимальные проверхности и калибровки на орбитах классических групп Ли" (1986 год) -
Браилов Андрей Владимирович
Кандидатская: "Вполне интегрируемые геодезические потоки на симметрических пространствах" (1986 год) - Тырин Алексей Владиславович
Кандидатская: "Геометрические свойства гармонических отображений римановых многообразий" (1986 год) - Сайед Ахмед Камиль Эль Махи (Египет)
Кандидатская: "Объемы орбит присоединенного действия компактных групп Ли" (1986 год) - Болсинов Алексей Викторович
Кандидатская: "Интегрируемые по Лиувиллю гамильтоновы системы на алгебрах Ли" (1987 год) - Крыстына Швая (Польша)
Кандидатская: "Инварианты и полные инволютивные семейства полиномов некоторых алгебр Ли" (1988 год) - Ле Хонг Ван (Вьетнам)
Докторская: "Калибровки и геометрия минимальных потоков на симметрическизх пространствах" (1989 год) - Иванов Александр Олегович
Кандидатская: "Минимальные поверхности и форма калибровки" (1989 год) - Тужилин Алексей Августинович
Кандидатская: "Исследование глобальных свойств минимальных поверхностей, их индексов" (1990 год) - Новикова Ирина Сергеевна
Кандидатская: "Минимальные конусы, инвариантные относительно присоединенного действия компактных групп Ли" (1990 год) - Ошемков Андрей Александрович
Кандидатская: "Топологическая классификация гамильтонианов в некоторых классических случаях интегрируемости гамильтоновых систем" (1992 год) - Нгуен Тьен Зунг
Кандидатская: "Сложность интегрируемых гамильтоновых систем на заданном изоэнергетическом трехмерном подмногообразии" (1992 год) - Трофимов Валерий Владимирович
Докторская: "Геометрические инварианты интегрируемых гамильтоновых систем" (1993 год) - Полякова Лада Станиславовна
Кандидатская: "Топологические инварианты алгебраических аналогов цепочки Тода и геодезических потоков с квадратичными по импульсам интегралами" (1993 год) - Птицына (Шклянко) Инга Вячеславовна
Кандидатская: "Замкнутые локально минимальные сети на замкнутых двумерных поверхностях постоянной гауссовой кривизны" (1994 год) - Болсинов Алексей Викторович
Докторская: "Траекторная классификация интегрируемых гамильтоновых систем с двумя степенями свободы" (1995 год) - Селиванова Елена Николаевна
Кандидатская: "Траекторная классификация геодезических потоков лиувиллевых метрик на двумерных многообразиях" (1995 год) - Кругликов Борис Серафимович
Кандидатская: "Симплектическая геометрия интегрируемых гамильтоновых систем" (1995 год) - Матвеев Владимир Сергеевич
Кандидатская: "Особенности отображения момента и топологическое строение интегрируемых геодезических потоков" (1996 год) - Топалов Петр Йорданов
Кандидатская: "Вычисление топологитческих инвариантов интегрируемых гамильтоновых систем" (1996 год) - Анисов Сергей Семенович
Кандидатская: "Задачи топологии, интегральной геометрии и сложности вычислений в теории особенностей" (1997 год) (Второй руководитель В.А.Васильев) - Аношкина Елена Валерьевна
Кандидатская: "Топологическая классификация случаев типа Горячева-Чаплыгина в динамике твердого тела" (1997 год) - Орел Ольга Евгеньевна
Кандидатская: "Топологические и траекторные инварианты интегрируемых гамильтоновых систем" (1997 год) - Тужилин Алексей Августинович
Докторская: "Классификация локально минимальных плоских сетей с выпуклыми границами" (1997 год) - Иванов Александр Олегович
Докторская: "Геометрические свойства локально минимальных сетей" (1998 год) - Борисенко Алексей Александрович
Кандидатская: "Построение глобально минимальных подмногообразий методом форм калибровки" (1998 год) - Калашников Вячеслав Владимирович
Кандидатская: "Особенности интегрируемых гамильтоновых систем" (1999 год)
(Второй руководитель - А.В.Болсинов) - Нгуен Тьен Зунг
Докторская: "Пуассоновы структуры и их нормальные формы" (2000 г., защищена во Франции, в ун-те г.Монпелье) - . Мантуров Василий Олегович
Кандидатская: "Скобочные структуры в теории узлов" (2002 год) - Хагигатдуст Бонаб Горбанали (Иран)
Кандидатская: "Топология слоения Лиувилля для новых интегрируемых случаев на алгебре Ли so(4)" (2004 год)
(Второй руководитель - А.А.Ошемков) - Браилов Юрий Андреевич
Кандидатская: "Геометрия особенностей интегрируемых систем на алгебрах Ли" (2004 год)
(Второй руководитель - А.В.Болсинов) - Коровина Наталья Валентиновна
Кандидатская: "Геометрия интегрируемых случаев динамики твердого тела" (2006 год) (Второй руководитель - А.В.Болсинов) - . Хоршиди Хоссейн (Иран)
Кандидатская: "Топология интегрируемого случая Стеклрова на алгебре Ли so(4)2" (2006 год)
(Второй руководитель - А.А.Ошемков) - Морозов Павел Валерьевич
Кандидатская: "Тонкая лиувиллева классификация некоторыэх интегрируемых случаев механики твердого тела" (2007 год) - Мантуров Василий Олегович
Докторская: "Геометрия и комбинраторика виртуальных узлов" (2008 год) - Зуев Константин Михайлович
Кандидатская: "Формальный метод сдвига аргумента и геометрия интегрируемых геодезических потоков" (2008 год)
(Второй руководитель - А.В.Болсинов) - Москвин Андрей Юрьевич
Кандидатская: "Топология особенностей дробно-рациональных интегрируемых систем" (2010 год)
(Второй руководитель - А.В.Болсинов) - Ошемков Андрей Александрович
Докторская: "Топология особенностей интегрируемых гамильтоновых систем" (2011 год) - Лепский Тимур Александрович
Кандидатская: "Интегрируемость комплексных гамильтоновых систем с неполными потоками в С2" (2011 год)
(Второй руководитель - Е.А.Кудрявцева) - Коняев Андрей Юрьевич
Кандидатская: "Алгебраические и геометрические свойства систем, получаемых методом сдвига аргумента" (2011 год)
(Второй руководитель - А.В.Болсинов) - Воронцов Александр Сергеевич
Кандидатская: "Инварианты и геометрические свойства орбит коприсоединенного представления групп Ли" (2011 год)
(Второй руководитель - А.В.Болсинов) - Деркач (Жданова) Мария Михайловна
Кандидатская: "Методы построения полных инволютивных наборов полиномов на полупрямых суммаах алгебр Ли" (2011 год)
(Второй руководитель - А.В.Болсинов) - Шнурников Игорь Николаевич
Кандидатская: "Распределение количества компонент связности дополнения к наборам замкнутых геодезических (2013 год) - Новиков Дмитрий Вячеславович
Кандидатская: "Топология особенностей интегрируемых гамильтоновых систем с некомпактными поверхностями уровня" (2013)
акад. А.Т.Фоменко доц. А.А.Ошемков - Славина Нина Сергеевна
Кандидатская: "Топологическая классификация интегрируемых систем типа Ковалевской-Яхьи" ( 2013 год)
акад. А.Т.Фоменко - Загрядский Олег Александрович
Кандидатская: «Геометрия гамильтоновых систем для многообразий и потенциалов Бертрана». (2015 год)
(Второй руководитель Е.А.Кудрявцева) - Федосеев Денис Александрович
"Конфигурационные многообразия обобщенной задачи Бертрана и гамильтоновы системы". (2015 год)
(Второй руководитель Е.А.Кудрявцева) - Фокичева Виктория Викторовна
Кандидатская: "Топологическая классификация интегрируемых биллиардов" (2016 год). - Кантонистова Елена Олеговна
Кандидатская: «Топологическая классификация интегрируемых гамильтоновых систем на многообразиях вращения в потенциальном поле». (2016 год). - Пермяков Дмитрий Алексеевич
Кандидатская: «Погружения графов в поверхности». (2016 год). (Второй руководитель – Е.А.Кудрявцева). - Тужилин Михаил Алексеевич
Кандидатская: “Инварианты 3-мерных и 4-мерных особенностей интегрируемых гамильтоновых систем”. (2018 год). (Второй руководитель А.А.Ошемков). - Николаенко Станислав Сергеевич
Кандидатская: «Топологическая классификация интегрируемых систем типа Чаплыгина-Горячева». (2019 год). - Ведюшкина (Фокичева) Виктория Викторовна
Докторская: «Интегрируемые биллиарды на клеточных комплексах и интегрируемые гамильтоновы системы». (2020 год, 28 августа). - Жила Александра Игоревна Кандидатская: «Топологические инварианты системы: шар Чаплыгина с ротором на плоскости». (2020 год, 23 октября). (Второй руководитель А.А.Ошемков).
Кроме того, А.Т.Фоменко был консультантом по следующим докторским
диссертациям:
Матвеева Сергея Владимировича
Шарко Владимира Васильевича